该选择多少个主成分 群体结构（population structure），或者说群体分层（population stratification），是由于个体之间非随机交配而导致的群体中亚群之间等位基因频率的系统差异。这种系统差异...

狗是第一个被驯化的动物，可能起源于与人类发生了密切接触的灰狼。不过，狗的起源仍有很多争议。虽然已经有不少这方面的研究，但绝大部分研究是基于现代的狗和灰狼进行溯祖，有些问题依旧未能解...

ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具，可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比，它的速度更快。它的下载地址是 http://dalexander.github.io/admixture/download.html，下载解压就可以使...

EHH（Extended Haplotype Homozygosity）、iHS（Integrated Haplotype Score） 和 XP-EHH（Cross Population Extended Haplotype Homozogysity）是常用的基于 haplotype 分析基因组受选择情况的...

文献信息 标题： Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases 中文标题： 日本人群的大规模全基因...

上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡（selective sweeep）的似然方法。选择扫荡可以增加群体之间的遗传分化，导致等位基因频率偏离中...