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GWAS_Flow：使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析
21世纪是生物的世纪，生物数据的增长速度越来越快。很多分析工具在开发时并没有考虑到大规模数据的应用场景。在数据量不大的时候，这些工具的计算时间并不会太长，可以让人接受。但在数据规模庞...
一键查看后端程序语言，分析网站技术栈
当看到一个网站，想要了解它用了什么技术开发，可以通过开发者工具去看，但这样的效率很低。下面推荐两个方便的工具： W3tech https://w3techs.com BuidWith https://builtwith.com/ 这两个网站...
日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座
文献信息 标题： Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases 中文标题： 日本人群的大规模全基因...
使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号
上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡（selective sweeep）的似然方法。选择扫荡可以增加群体之间的遗传分化，导致等位基因频率偏离中...
使用XP-CLR检测基因组中的选择信号
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方法，全称叫 the cross-population composite likelih...
年轻人的第一台服务器：最低不到五千，捡垃圾搭建自己的科学计算平台
开篇三问 Q：有什么需求？ A：跑耗资源的科学运算。 Q：为什么捡垃圾？ A：因为穷。 Q：怎么捡垃圾？ A：全能的淘宝。 三个开篇问题，算是写这篇剁手文章的借口理由。普通 PC 很难支撑得起耗费...
炼丹入门必备：迈向调参之路的新手指南（深度学习篇）
选定学习路线 上回介绍了机器学习的入门指南，这一次轮到更为火爆的深度学习。深度学习有非常多免费的优质课程，不用花钱就能在家享受名师教学的体验。这一次，也主要是介绍免费的资料。 深度学...
炼丹入门必备：迈向调参之路的新手指南（机器学习篇）
避免成为资料收藏家 机器学习越来越火爆，各种资料也越来越多。在网上随意一搜，就能看到一大串长长的书单和一大堆视频教程。堆积如山的资料，很容易让新手一脸懵逼，无所适从，最后没当成炼丹...
Linux无root权限通过Anaconda虚拟环境安装R并在Jupyter Lab运行
一般情况下，R 的安装非常容易。但如果是在linux服务器上，而又没有root权限，安装就比较麻烦了。最直接的方法是自己在有读写权限的目录中编译安装，但过程非常繁琐，需要解决非常多依赖库，整...
face3d: 3D人脸处理Python开源工具
简介 3D 人脸是非常有趣的研究领域。face3D (https://github.com/YadiraF/face3d) 是一个基于 Python 的开源项目，实现了 3D 人脸研究的众多功能。它可以处理网格数据，用形变模型生成 3D 人脸...
精打细算，域名比价网站大全
不同域名注册商的注册价格还是有不少差别的。本着一分钱也是钱的精打细算精神，下面推荐几个域名比价网站。 Tld-list https://zh-hans.tld-list.com/ 国外的比价网站，涵盖了一千多个域名后缀。...
Docker快速部署GitLab搭建私人仓库
黑五抢了个Virmach的大内存机器，终于可以折腾下超级吃内存的GitLab。GitLab的安装方式有好几种，个人比较建议用Docker，部署快速，而且不容易影响机器本身安装好的服务。 Docker安装 CentOS 7 ...
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