文献速读共9篇

生物信息学家、计算机科学家和遗传学家,谁主导开发的生物信息学工具更好?-实验盒

生物信息学家、计算机科学家和遗传学家,谁主导开发的生物信息学工具更好?

新西兰奥塔哥大学高级讲师(Senior Lecturer ) Paul P. Gardner 在 bioRxiv 上发表了一篇名为《A Bioinformatician, Computer Scientist, and Geneticist lead bioinformatic tool development...
8月29日 09:59
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ICML 2024|用于统一分子建模的多尺度蛋白质语言模型ESM-AA-实验盒

ICML 2024|用于统一分子建模的多尺度蛋白质语言模型ESM-AA

多模态蛋白质语言模型是一个新兴的方向。 《Multi-scale Protein Language Model for Unified Molecular Modeling》是一篇发表在ICML 2024的文献,作者是 Kangjie Zheng、Siyu Long、Tianyu Lu...
CVPR 2014| BioCLIP:生命之树的视觉基础模型-实验盒

CVPR 2014| BioCLIP:生命之树的视觉基础模型

BioCLIP 是一个利用图像和结构化生物知识回答生物学问题的多模态大模型。通过在生命之树(生物学分类)上训练模型,增强了对自然界层次结构的理解,具有强大的可泛化性。文章还创建了 TreeOfLif...
5月29日 10:56
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Genome Biology|常用计算工具会产生相互矛盾和过于乐观的AUPRC值-实验盒

Genome Biology|常用计算工具会产生相互矛盾和过于乐观的AUPRC值

在生物医学和生物信息学领域,PRC 和 AUPRC 有着非常广泛的应用。然而,常用的计算工具本身存在的问题可能会被研究人员忽略,从而可能导致对结果解读的偏差。2024 年 5 月,香港中文大学曹沁研...
Science|持续数十年的实验,通过细菌研究突变在演化过程的适应性效应-实验盒

Science|持续数十年的实验,通过细菌研究突变在演化过程的适应性效应

突变对生物体适应度(fitness,生存和繁殖的能力)的影响,可能会受到后续突变的影响,这可能会限制未来的适应性进化路径。这些变化如何发生、会产生怎样的影响,尚缺乏具体的数据。近日,《Sci...
文献速递|估算中国人群生理年龄的DNA甲基化时钟-实验盒

文献速递|估算中国人群生理年龄的DNA甲基化时钟

标题 DNA methylation clocks for estimating biological age in Chinese cohorts 期刊和影响因子 Protein & Cell (IF: 21.1 , JCR Q1, 中科院大类 Q1 小类 Q2) 简介 文章主要介绍了在中国...
3月29日 17:40
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[文章分享] Biobank测序时代的罕见变异关联分析进展综述-实验盒

[文章分享] Biobank测序时代的罕见变异关联分析进展综述

「文献题目」 Recent advances and challenges of rare variant association analysis in the biobank sequencing era 「中文标题」 生物样本库测序时代罕见变异关联分析的最新进展和挑战 「期...
史前化石揭示狗的起源和群体历史-实验盒

史前化石揭示狗的起源和群体历史

狗是第一个被驯化的动物,可能起源于与人类发生了密切接触的灰狼。不过,狗的起源仍有很多争议。虽然已经有不少这方面的研究,但绝大部分研究是基于现代的狗和灰狼进行溯祖,有些问题依旧未能解...
10月30日 21:59
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日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座-实验盒

日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座

文献信息 标题: Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases 中文标题: 日本人群的大规模全基因...