Nat. Biotechnol|仅需4卡3.5小时训练的DNA语言模型助力变异效应预测
预测基因组变异的效应是一个研究热点。随着全基因组测序技术的普及,我们积累了海量的基因组数据,但如何准确解读这些变异的生物学意义,尤其是非编码区变异的功能,仍然是一个巨大的挑战。 为...
BioMaster:基于多智能体的生信自动分析系统
在生物信息学领域,随着生物数据的爆炸性增长,分析流程的复杂性也在不断增加。传统的生物信息学工具和流程往往依赖于大量的手动操作,这不仅效率低下,而且难以扩展。近年来,基于大型语言模型...
当我用DeepSeek预测AI for BioScience未来3-5年发展趋势
预测未来3-5年AI在生物科学(AI for BioScience)的发展趋势,可以从技术突破、跨学科融合、数据驱动创新以及伦理监管等多个维度进行分析。以下是一些关键趋势的展望: 1. 蛋白质与分子设计的革...
AI医院:大语言模型在多智能体医疗交互模拟器中的表现如何?
近年来,人工智能(AI)技术,尤其是大语言模型(LLMs),在医学领域取得了显著进展。这些模型在静态医疗问答任务中表现优异,甚至在某些情况下能够媲美人类专家。然而,医学诊断并非单一静态的...
万字综述|一文掌握大语言模型在生物信息学中的应用
随着大语言模型(LLMs)技术的飞速发展,其在自然语言处理(NLP)领域的成功应用逐渐扩展到了生物信息学领域。生物信息学作为一个跨学科的领域,涉及基因组学、蛋白质组学、药物发现等多个方向...
NBT|BioChatter:为生物医学量身定制的开源大语言模型应用平台
引言 近年来,生成式人工智能尤其是大语言模型(LLM)取得了显著进展,但在生物医学研究中的应用仍处于起步阶段。目前,生物医学研究工作者使用LLM主要有两种途径:一是大型企业提供的商业平台...
提示词学习资源全攻略:从入门到进阶,一键开启AI创作之旅
在当今的AI时代,Prompt(提示词)已经成为与人工智能交互的关键桥梁。无论是生成文本、图像,还是开发AI应用,掌握Prompt技巧都至关重要。 为了帮助大家快速上手并深入理解Prompt的使用方法,...
Sci. Adv.|MOBER:深度学习助整合多源癌症转录组数据,打破临床与实验模型的壁垒
引言 癌症研究中,实验模型如癌细胞系和患者源性异种移植模型(PTX)一直是科学家们探索癌症生物学和开发治疗手段的重要工具。然而,这些模型与实际临床肿瘤之间存在显著差异,特别是在基因表达...
bioRxiv|L2G:一张GPU卡也能训的基因组学语言模型
预训练语言模型(如BERT、GPT等)在自然语言处理(Natural Language Processing, NLP)领域取得了显著进展,其在多种语言任务中的表现令人瞩目。这一成功激发了基因组学领域的研究者们尝试开发...
Nature|时空单细胞分析新突破:moscot框架实现多组学数据高效映射
引言:单细胞组学的挑战与最优运输的潜力 单细胞多组学技术(如scRNA-seq、空间转录组)为解析细胞异质性和组织动态提供了前所未有的分辨率。然而,实验技术的局限性导致细胞在天然时空背景下的...
BioAgents:基于多智能体系统的生物信息自动分析工具
生物信息学作为一个数据密集型和跨学科的领域,涵盖了从基因组测序到蛋白质结构预测等多种复杂任务。然而,构建和优化这些任务所需的分析流程通常需要跨多个学科的专业知识,这对研究人员提出了...
稀疏基因组学:大规模基因组分析的新范式
随着基因测序技术的飞速发展,我们面临着一个巨大的挑战:如何高效地处理和分析海量的基因组数据。 2025年1月21日,发表在《Nature Communications》上的一篇论文提出了一个名为“稀疏化基因组...